|
Popis vyšetření: Vyšetření metylace genu MGMT
Zařezeno v kategoriích: Synonyma:
O(6)-methylguanine-DNA methyltransferase, methylation
Preanalytická fáze:
K vyšetření je třeba řez tkáně zalité v parafinovém bločku nebo tkáň nativní. Vyšetření se provádí z DNA extrahované z parafinového bločku po deparafinizaci. Nejčastěji jsou založené na práci s extrakčními mikrokolonkami. DNA se po izolaci charakterizuje fluorimetricky nebo pomocí real-time PCR. Pro dlouhodobější (déle než týdenní) uchování DNA se používá zamrazení vzorku DNA.
Poznámky k analytické metodě:
Cíl vyšetření: Vyšetření metylace CpG ostrůvků v exonu 1 genu MGMT u osob s kolorektálním karcinomem, nádory plic, prsu, mozku. Přístup z OMIM katalogu (Online Mendelian Inheritance in Man): 156569 Při vyšetření CE-IVD soupravami se preferují založené na bisulfidové modifikaci nemetylovaného cytosinu v analyzované DNA a následném sekvenování. CE-IVD souprava by vždy měla obsahovat kontrolní vzorky s metylací a bez metylace.
Významné interference:
Nebyly popsány, zásadní je stupeň degradace DNA působením fixativa (formaldehyd). |